Hröð og hrein, auðveld útdráttur úr jarðvegs-/saur-DNA með Big Fish Sequence

Jarðvegur, sem fjölbreytt vistfræðilegt umhverfi, er ríkur af örverufræðilegum auðlindum, þar á meðal fjölbreyttum örverutegundum eins og bakteríum, sveppum, veirum, blágrænum, aktínómýcetum, frumdýrum og þráðormum. Þær hafa fjölbreytt efnaskipta- og lífeðlisfræðileg einkenni og gegna lykilhlutverki í næringarefnahringrás jarðvegs og eru nauðsynlegar til að fjarlægja mengunarefni úr jarðvegi. Þar sem jarðvegur er eitt líffræðilega fjölbreyttasta umhverfi jarðar eru sameindalíffræðilegar rannsóknir á honum einstaklega mikilvægar. Í þessu ferli er að fá örverufræðilegt DNA úr jarðvegssýnum fyrsta skrefið í jarðvegsrannsóknum og mikilvægasta skrefið fyrir árangur tilrauna á eftir. Hins vegar, auk ríkra örverufræðilegra auðlinda, inniheldur jarðvegur oft mikið magn af umbrotsefnum (húmínsýru, xantínsýru og öðrum húmínefnum), sem auðvelt er að hreinsa ásamt kjarnsýrum við útdrátt kjarnsýrunnar, sem hefur áhrif á PCR og raðgreiningarferlið á eftir.StórfiskurRaðgreiningarbúnaður fyrir erfðaefnishreinsun í jarðvegi og saur getur dregið út hreint og mjög einbeitt erfðaefni úr humusríkum sýnum eins og jarðvegssaur á skilvirkan og hraðan hátt, sem er öflugur hjálparhellir fyrir rannsóknir á fjölbreytileika vistkerfa örvera í jarðvegi.